Buenas. Lo primero de todo decir que al ser un tema tan delicado todo lo que hagas va a tener repercusiones en ti aunque sea injusto.
Yo lo que haría sería hablar con tu hermano seriamente y darle la elección de decírselo el mismo y gestionar la situación a su voluntad. De lo contrario, yo misma se lo comunicaría a su mujer. Tú misma has dicho que es una buena mujer y que no se merece lo que tu hermano está haciendo.
No te sientas responsable de romper ningún matrimonio porque eso lo ha hecho tu hermano él solito. Yo me conozco y sé que no podría hacer como si nada y tratar igual a mi cuñada. Sería algo que me pesaría constantemente. Ahí tienes que valorar si te pesa más la lealtad hacia tu hermano (que también tiene bastante peso) o hacer lo más justo.