Tienes la mentalidad muy abierta y respetas mucho todo por lo que no creo que sea transfobia, desde mi total ignorancia puedo pensar que simplemente esa chica no te acaba de caer bien o qué no tengas una buena conexión con ella y de ahí esos pensamientos ya que solo te pasa con ella

Me parece que te estás obcecando con querer verla «como mujer». Deja de intentar que encaje en tu cabeza el concepto «mujer». Sí que te falta deconstruir lo que en tu cabeza significa esa palabra, porque creo que aún tienes estereotipos de género ahí cogiditos. Ella es una persona, se identifica como mujer y estás haciéndolo bien refiriéndote a ella como tal, pero la verdad es que simplemente es otra persona más. Da igual el aspecto que tenga, cómo se comporte o cómo se comporte el resto del mundo hacia ella. Hay machirulos que son gays reprimidos y si tiene rasgos masculinos, más de uno caerá sin saberlo, igual pensando que «esa tía sí me mola a mí». Porque nadie es completamente hetero, absolutamente todo el mundo sabe cuando una persona del sexo que sea le resulta atractiva o no.
Resumiendo, lo estás haciendo bien, sigue por dónde vas, libérate de que ser mujer tenga que significar algo concreto y de que los machitos se tengan que ver todos atraídos por un tipo determinado de mujer (no sé si así escrito ves lo absurdo que suena asumir que todos tengan los mismos gustos).
Y ojo, te puede caer mal esa persona, puede no gustarte su manera de actuar y puedes no estar de acuerdo con ella en cómo hace las cosas. Pero eso no te hace tránsfoba, simplemente tienes valores diferentes a ella como diferirás con tantas otras personas en este mundo. Ánimo ;)

Tengo dos teorías al 50/50… o te gusta ella, o le tienes envidia… transfobia no es.

A ver, yo difiero un poco con los anteriores comentarios, creo que sí hay transfobia. Pero hay transfobia interiorizada, todo el mundo la tenemos y los roles de genero veo que los tienes como muy marcados. Por eso cuando dicen que no eres transfoba solo por tener amistades trans me parece una chorrada.
Pero como dijeron en un comentario por desgracia es lo más normal, tu lo identificas y lo detectas, y eso ya es un gran paso, ahora tienes que combatirlo. Intenta deconstruir el concepto que tienes como mujer, intenta conocerla más y piensa que lo que tiene entre sus piernas no le impide tener relaciones sexuales.
Yo soy muy feminista y también defensora lgtbq+ pero aun así tengo pensamientos, muchas veces intrusivos, otras inconscientemente, machistas o lgtbfobicos. Y tmbn pasa con pensamientos racistas cuando intento aprender de antirracismo y ser una aliada. Pero es normal, vivimos en una sociedad con estas ideas y nosotrs desde muy peques es lo que vamos aprendiendo.
Pero estás en el camino correcto, un beso.