Hola. No soy madre ni he abortado nunca, así que mi opinión quizá no sea muy válida, pero creo que es lo que haría en tu situación:
siendo joven como para poder seguir intentando tener otro, yo abortaría. Creo que traer un hijo al mundo con una patología es muy duro y requiere mucho más esfuerzo a todos los niveles del que ya de por sí requiere un hijo sin ellos. Además, ya tienes otra hija que también necesitará atención y recursos, cosa a tener en cuenta.
Sin embargo, también depende mucho de tus circunstancias personales y laborales, y el nivel de sacrificio que te supondría. Yo personalmente lo veo así porque no tengo mucha red de apoyo.
De todas maneras, también creo que podrías ir a otro profesional y pedir una segunda opinión.
Mucho ánimo.