Hola:
En un bautizo católico no es necesario tener padrinos. De hecho, los padrinos son una figura que se encargan de la transmisión de la fe al niño en caso de que, por cualquier causa, los padres faltasen. Por lo tanto, no, tu cuñada de una religión completamente diferente y contraria no puede ser madrina. Tiene fácil solución, nadie de tu entorno está capacitado para ser padrino, no pongas ninguno. Yo me planteo exactamente eso en el bautizo de mi segundo hijo.