Hola,soy funcionaria de la TGSS en la unidad de autónomos, al tratarse de una incapacidad temporal por enfermedad común hasta los 60 días tendrías que hacer frente a tu cuota de autónomo, transcurridos ese periodo sería la mutua la que se hace cargo y tú no tendrías que pagar nada…Tienes opción de hablar con tu mutua y tratar de ver si podría considerarse la opción de cese de actividad en tus circunstancias.