Parece que la única razón para aceptarlo es «generar una mala impresión» en quien te ha contactado porque CONOCE a tu director de tesis. No quieres que esto afecte tu relación profesional ni académica, ¿con quien? ¿con el director de tu tesis? ¿Es que acaso él te ha conseguido el trabajo o et ha puesto con contacto con ellos de alguna forma? ¿Crees que esta persona iría a contarle que no has aceptado el trabajo? ¿Realmente impactaría en la consideración que tiene de ti si llevas años trabajando con él en la tesis?
Yo les diría que muchas gracias por haberte tenido en cuenta pero que en este momento no puedes aceptarlo, si te han contactado después de meses les argumentaría que en el momento de echar el CV estabas buscando unas cosas pero que ahora mismo estás centrada en la tesis para acabarla cuanto antes, que te lo has marcado como prioridad y objetivo para los próximos meses, y que hablaréis cuando termines (si es que estás interesada, claro, pero díselo de todas formas que quedas mejor).
La verdad, no sé que edad tienes, de qué sector hablas… pero las condiciones son lo mínimo de lo mínimo legal y no sé ni si eso…