Empezando por lo principal, prejuicios tienes.
Si no te atrae el chico solo por qué tiene vagina y no pene entonces es transfobia. Para empezar lo que deberías haber hecho ya, antes incluso de publicar esto es llamarle, quedar con el y disculparte por como actuaste. El no tiene por qué disculparse contigo, entiendo que tú en un primer momento puedas sorprenderte por qué no te aviso, pero para las personas trans no es algo fácil de tratar ya que día a día se exponen a muchísimo odio por parte de la sociedad.
Si tienes un poco de decencia llámale y discúlpate y no le hagas sentir peor de lo que ya debe hacerlo. Y si el chico te gusta no te tienen que importar sus genitales, solo disfruta de el. Además si estás preocupada por el sexo te aseguro que a veces son ellos los que están mil veces más incomodos que nosotras (te lo dice alguien que ya ha salido con una persona trans).