De momento creo que lo estás haciendo fenomenal, habla con el cole y con alguna asociación LGTBIQ a ver si pueden dar alguna charla, lo otro que se me ocurre es que hables con la mama del niño gay y que los actos de tu hijo si no están bien tengan consecuencias, si en el cole te dicen que ha pasado algo hará falta alguna con secuencia, una carta de disculpa por ejemplo, ante la duda contacta con algún profesional del tema que pueda orientarte, pero creo que tu preocupación y ganas de actuar ya representan un paso importante, ánimo, vivimos en una sociedad homofoba y los niños son como esponjas sin filtro, necesitará madurar más, pero hasta entonces hay que velar por el bienestar del otro niño