Yo haría dos cosas, lo primero hablar con tu hija tranquilamente, que te exponga sus motivos y no con un «mis motivos tengo» lo dé por zanjado. No es qué le quieras cambiar de idea, si no que le expongas que puede que no sea tan fácil que lo autoricen por las circunstancias que has descrito. A la vez, iría a preguntar a la iglesia que te corresponde, suele ser la más cercana a tu domicilio, a informarte y exponerle la situación al párroco. Los hay de todos tipos, algunos te dirán que no y otros no te ponen pegas. Si en esa iglesia no puedes prueba en otras, que seguro que en alguna no te ponen trabas. Y por el papeleo, para bautizar, solo es rellenar un papel con los datos del bautizado, quienes son los padres y quiénes van a ser los padrinos, nada más. De la comunión no te puedo decir porque mi hija es pequeña todavía y no sé cómo irá el tema, pero imagino que tendrá que hacer la catequesis primero y luego recibir la comunión.