Mil veces me ha pasado también. A veces les hacía un corte de mangas y a veces les ignoraba sin más. Ahora salgo poco a correr pero por otros motivos.
Mi opinión es que si te gusta hacerlo sigas con ello, no te limites a ti misma por culpa de esta gentuza. A los machistas les encanta hacernos sentir que el espacio público no es nuestro, no les demos el gusto de abandonarlo.
Además de correr con cascos como dice la chica del comentario anterior, se me ocurre que puedes buscar un parque, donde más gente hace ejercicio y suele ser más respetuosa. Por lo que dices, supongo que vas por la calle y ahí es donde yo me encontraba también más acoso.