Si decides prescindir del preservativo, hazte tú antes una analítica completa y pídesela a tu chico también. Al margen de que creas que vaya o no vaya haciéndolo sin protección por ahí.
Los efectos secundarios de un anticonceptivo hormonal dependen del tipo y la cantidad de hormonas, más que de cómo se administren (pastilla, parche, anillo…) Así que sí, lo que te ha dicho tu médico tiene todo el sentido del mundo. Otra cosa es cómo te afecten a ti esos efectos o qué método te va mejor.
Lo importante es: ¿tú quieres hormonarte? Personalmente, yo intentaría usar preservativos más finitos, o cambiar los preliminares, y él se irá acostumbrando.