Hola Inma!
Ahora mismo lo más importante es que trates exhaustivamente el tema del metotrexato! Se trata de un fármaco que es extremadamente teratogeno, es decir, causa malformaciones fetales muy muy severas.
De hecho, su uso es generalmente quimioterápico o como inmodulador de enfermedades autoinmunes, a las mujeres que quieres quedarse embarazas recomiendan que dejen el tratamiento mínimo 6 meses antes.
Por favor, habla de estos efectos con tu ginecólogo, pide segundas opiniones por si tienes que interrumpir el embarazo (ojalá y no). Es cierto que el ácido fólico puede minimizar los efectos del fármaco pero NO siempre es así, el riesgo de teratogenicidad es muy muy alto.
Muchísima suerte, y ánimo!