Ir detrás de él no te conviene a tí, que te convertirás en tu chacha como dicen en otros comentarios, pero quizás le pueda sentar mal a él también. Llegas y empiezas a hacer las cosas a tu manera (a hacerlas bien en general), y él puede sentirse un poco invadido. Lo mejor es que él vea y decida por si mismo que es mejor ser más limpio y organizado. Por otro lado también deberías aceptar una parte de «es su casa, él es así, no puedo cambiar todo lo que no comparto».
Si no estás cómoda con ciertas cosas háblalo, es la forma más fácil de llegar a un entendimiento, con la premisa de que os comprenderlos mutuamente y llegar a un acuerdo para estar mejor.