A mí me parece normal que no te guste la idea. Es bastante reciente para la relación larga que es, como dices. Y teniendo en cuenta que quedaron a propósito en Madrid, me da que se gustaban de antes.
No puedes impedir esa relación ni lo que ya haya pasado pero tampoco tienes por qué seguir en contacto con ellos si deciden seguir adelante.