En primer lugar, no, no es baja medica la faringitis salvo que de fiebre, la afonia no esta considerada motivo de baja, por mucho que trabajes hablando.
Y por otro lado, tienes derecho a faltar al trabajo hasta 3 dias sin justificante y que no te lo quiten del sueldo, revisa el convenio, pero vaya, casi seguro que si.