Sé cómo te puedes sentir y como bien dices cada gato tiene su forma de ser, al final con tu otra gata hay buen rollo entre ellas tal vez porque son la misma especie y oye pues entre ellos se entienden.
La verdad no creo que podáis hacer mucho, si ella es así, poco puedes hacer más allá de seguir teniendo paciencia y respetando su forma de ser.
Tengo una amiga que tiene dos gatos y uno es como la tuya, de los humanos poco quiere saber alguna vez se echa con ellos y la tocan y bien pero poco más, va a su bola y también es asustadiza y con el otro se lleva genial también. (Vamos es que es tu situación tal cual)
Ya llevan con el creo que 4 años, lo cogieron con dos meses y la cosa no ha cambiado.
Ya solo el que te preocupes por si ella está bien y que quieras que lo esté dice de vosotros que la queréis muchísimo. Estoy segura que está bien, pero es así, tal vez tuvo alguna mala experiencia con algún humano cabron y le cueste.
Tiempo al tiempo, y si no, pues nada, tenéis que quererla asi.
Se me ocurre si no que contactéis con algún profesional en estos temas a ver qué os dice o incluso hay unos difusores que se enchufan como si fuera ambientador feeliway se llama, y suele ir muy bien, busca el que se adapte a las necesidades de tu gato y pon un par por la casa, uno donde más este y otro en otro punto que se expanda por la casa, échales un ojo!