La autoestima te la minan precisamente personas como la profesora de tu hijo. Lo que debes hacer es lo que dijiste que lo intente, si necesita ayuda con la carrera que la pida (como hemos hecho muchos con pasantías o profesores particulares) Por experiencia lo digo, y en caso de que no pueda ser pues estarás ahí para darle ánimos y el empujón para probar otra cosa.
Recuerdo cuando en 4° de la ESO nos hizo la orientadora un test, según el cual los resultados mostraban que profesiones en las que por nuestra personalidad (o no se yo en que se basaba) más encajabamos. Mensaje que se me transmitió: haz FP, tú no vales para sacarte una carrera… El cabreo que cogí fue monumental pero yo me dije: ¿que no puedo hacer qué? Ya verás como sí, se van a cagar. Actualmente, una carrera y dos másters.
En definitiva, que estudie lo que quiera, o que al menos lo intente, y tu a su lado apoyándolo para que no se rinda.