Mi experiencia en el cole se parece a lo que cuenta Ladycat. En mi clase había dos gemelas y al apoyarse una en la otra (aunque siempre era una la que llevaba la voz cantante), eran como pequeñas tiranas con el resto. Dudo que de haber estado separadas hubiera esa dinámica.
Creo que actualmente se les separa precisamente para facilitar la integración con los demás niños y el desarrollo de la personalidad de manera independiente. Personalmente, a mí me parece que, aunque al principio les pueda costar un poco, a la larga será bueno para ellos. Tú no te cansarías de estar con tu hermano o hermana 24/7 durante años? En casa, en clase… Tener cada uno su espacio creo que es positivo.