No creo que ser ateo sea un defecto, como ya dijiste todo el mundo tiene derecho a creer en lo que sea. Pero vamos que si va burlándose, eso es ser grosero e irrespetuoso, no intolerante, no se le puede decir de otra forma. Creo que debes ir pensando si tu estas dispuesta a tolerar eso; por más inteligente, trabajador y bueno que sea, debes saber que hay muchos así, y además son respetuosos. No tienes que tolerar nada que tu no quieras.
Además, a la larga seguro que te pasa factura que él actue así :(