Hola! Es importantísimo que los niños aprendan a respetar los límites de otras personas, al igual que aprender a poner los propios. Cuando tú le dices que algo que te está haciendo A TI no te gusta no estás interfiriendo en la crianza, estás marcando tus límites. Quizá con solo decirle que no quieres que haga eso, que no te gusta, es suficiente, no entres a hacerla reflexionar. Poco a poco la irás conociendo y sabiendo como planteárselo para que sea efectivo. De esta forma ella también aprenderá a hacerlo cuando algo no le guste. Es una forma de explicárselo a su padre también, no le estás riñendo, estás marcando tus límites.
Por otro lado, es una niña muy pequeña, en una situación complicada que no ha elegido y que no le gusta. Dale tiempo, está canalizando sus emociones, trátala siempre con cariño y respeto a pesar de que ella no lo haga, se aprende más del ejemplo que de la charla. Intenta compartir con ella momentos de juego, que se lo pase bien contigo y verás como poco a poco te irá aceptando.
También comentas que se enfada cuando presencia un momento cariñoso entre vosotros, os está diciendo que esto le duele, evitadlos en su presencia hasta que se haya adaptado a la nueva situación. Enfadarse es su forma de decir que no le gusta, respetad sus límites también.
Mucha suerte, es una situación difícil, pero no imposible. Ánimo!!

Lo que yo no sé es por qué narices tenéis que salir los tres juntos, más aún si acabas de empezar con él! La niña con quien tiene que estar es con su padre, no que le meta por los ojos a su nueva novia (que a saber cuántas lleva ya) a la que está preparando para ser la canguro gratis.