Yo estuve un año trabajando en un piso tutelado con chicas adolescentes y tampoco me pidieron que realizara esas labores. Solo puedo decirte lo que ya te han indicado, que te asegures de los pasos que tienes que dar si te vieras obligada a hacerlo.
Soy titulada en enfermería y te puedo decir que, más adecuado que empezar unos registros exhaustivos de lo que tienen las chicas, es útil observar su comportamiento y estado fisico. Cuando consumen marihuana, normalmente sufren fuertes bajadas de tensión, si les controlas la p.a. con un tensiómetro lo puedes ver muy fácilmente. Otras drogas tienen síntomas muy claros también. Hay que tener en cuenta que en esos centros semiabiertos no sirve de mucho controlar lo que tengan dentro del piso, lo importante es lo que puedan hacer fuera.
Hace poco tiempo salieron a la luz varios casos de menores tuteladas que habían entrado en redes de prostitución o tráfico de drogas, es posible que el exceso de celo de tus superiores venga originado por esto.
De todos modos, tampoco entiendo mucho tus reparos a hacer a las chicas el registro en DI. En el tiempo que estuve en el piso las chicas salían desnudas de la ducha y no les importaba que las responsables les viéramos. Igual es por mi trabajo de enfermera, y no le doy importancia, yo lo hubiese hecho sin demasiados problemas, igual me hubiese metido en un conflicto sin darme cuenta. Pero si tuviera que revisar que una menor no esté cayendo en el consumo de drogas o estuviera sufriendo abusos lo haría por su propio bienestar.
De todos modos, asegurate bien de cada paso que das.
Un fuerte abrazo.

De momento no he tenido que aplicar el protocolo.