Ser virgen no es solo haber tenido relaciones sexuales con penetración. Hay muchas maneras de tener relaciones sexuales.
Tu gine sí puede intuir que hayas tenido o no relaciones sexuales con penetración según como de dilatada vea la entrada a tu vagina, pero por ejemplo una chica virgen si ha utilizado dildos, puede tener la entrada algo dilatada igualmente. De todas maneras cada persona es diferente y cada cuerpo es diferente así que no necesariamente tiene por qué saberlo. Lo más lógico sería que te lo preguntase directamente, que es lo que suelen hacer.
Por otra parte, tu ginecólogo no debe decir ABSOLUTAMENTE NADA sobre tu vida ni sobre tu salud a NADIE a no ser que tu se lo pidas. Saltarse el secreto médico es un delito penal. Si eres menor de edad, pero tienes más de 16 años, tampoco puede decirles nada si tu no quieres, porque se te considera una menor madura ante la ley, aunque el hecho de ser «maduro» o no, también se supone que lo dictaminará el propio médico (en caso de querer abortar, tal y como está la lay ahora sí necesitas la autorización de tus tutores legales si eres menor de 18 años). Si tienes menos de 16 años, entonces puede decirles lo que le parezca oportuno, así que ojo con esto si es que es amigo de tus padres.
Por último, te recomiendo que si puedes evitar acudir a ese ginecólogo, lo hagas, puesto que no confías en el de entrada por el hecho de ser amigo de tus padres (no sé qué tipo de ideales pueda tener este médico,
pero entre los médicos hay de todo al igual que en la calle, y hay mucho meapilas también). Si necesitas ir, vete donde uno que no conozcas y que vaya a ser neutral. Estas en tu derecho a negarte a que te vea esta persona, seas mayor o menor de edad y también estás en tu derecho a contarle todo esto que te supone un problema a cualquier otro médico, no permitas coacciones.