@Lola, lo siento pero no te dejarán en el registro poner el apellido de tu madre a tu hijo. Lo malo, es que has creado una polémica en casa de algo que no puedes llevar a cabo.
Aunque hay una opción, y es que hagas un trámite para cambiar el orden de tus apellidos antes, entonces el de tu madre estará primero y se lo podrás poner a tu hijo. Pero eso es una faena increíble, prepárate a pedir cambios a todo lo que estuviera tu nombre: títulos, titularidades, documentos oficiales, etc.