Creo que es totalmente lógico que te sientas molesta con la situación, a nadie nos agrada tener que lidiar con este tipo de situaciones. Ya que comentas que mantienes una relación muy sincera con tu chico le plantearía de nuevo la situación explicándole el malestar que te genera y tu interés en que todo esto se zanje, no me parece justo que tengas que discutir con tu él por este tema.
Personalmente no creo que debas escribirle a la chica, ya que todos somos adultos y debemos apechugar con nuestros propios problemas, el único que debe escribirle y explicarle la situación es él. Simplemente ser sincero y educado con ella y si sigue insistiendo bloquearla de las redes sociales, Whatsapp etc, una cosa es ser empático, que te de pena porque has sido una persona importante en tu vida, que te sepa mal, que valores el tiempo pasado y otra cosa muy diferente es llegar al punto de terminar mal con tu actual pareja por no saber cerrar una puerta del pasado.
Si aún así sigue sin bloquearla, sin parar la situación tendrías que plantearte el porqué prefiere seguir teniendo este tipo de «contacto» con ella teniendo la solución en la mano.