A ver, primero, entiendo que tu novia no es que quiera ser trans, es que lo es, solo que habrá decidido operarse. Está mal expresado tanto en el título como en el post. Ser trans no es operarse.
No sé que edad tenéis ni que relación tiene ella con su madre, el tema es que, en cualquier caso, la decisión es de tu novia.
No sé por qué tiene que elegir entre uno u otro. Que participen los dos en su justa medida. Si ella quiere que su madre esté en casa pues bien, pero si no, pues que se lo diga, todo tiene que ser decisión de ella, ni de su madre, ni tuya, así que intentad no hacerle sentir mal por sus decisiones.