Primero mucho ánimo, puedes buscar ayuda en algún grupo de padred y madres, o en alguna psicologa especialista en niños. No pasa nada por preguntar, no pecas de exagerada, simplemente una madre preocupada.

No sé, tengo la impresión de que la niña sigue diciendo éso, a pesar de que supongo yo que no es verdad, porque ha visto que te afecta, y éso le debe maravillar en cierta forma. De manera totalmente inocente se ha dado cuenta de que tiene poder sobre ti.
Pero tiene sólo tres años. Seguramente será fácil hacer que se olvide de decir ésto, ¿no?
Para empezar no hay que hacerle ni caso cuando dice éso. Puedes o ignorarla directamente, o utilizar alguna táctica de distracción. Cambia de tema, habla de algo que despierte su interés. ¿Qué le gusta en este momento? ¿Algún dibujo animado, algún juguete, alguna canción, algún libro? Habla de éso. O ponte a bailar con ella. O pon cara tontas y divertidas. O de manera exagerada haz ver que es ELLA la que huele mal.
Tengo la impresión de que si le quitas importancia al asunto, se aburrirá muy pronto de decirlo. Pero si reaccionas tomandotelo en serio, seguirá haciendo este paripé un tiempo más largo.
Esta es mi opinión personal, claro. Es lo que haría yo con mis hijos.

Hola! La nena reacciona así con otros olores, texturas, alimentos o ruidos? O solo es contigo? Observa su conducta y analiza cuando ocurre. Esa conducta puede tener una base de alteración de la integración sensorial y puedas consultar con un terapeuta ocupacional pediátrico. Si solo ocurre contigo quizá sean llamadas de atención. Mucho ánimo!

Ignorala, no a la niña, al comportamiento no le des importancia cuando lo haga, yo intebtaria hacer cosas con ella en las que se tuviera que acercar ella a mi cocinar juntas y cosas asi, cuando te empieze a decie que hueles mal cambiale de tema sobre algo que le guste a ella, son fases necesita llamar tu atención y mada mas, quizas cambio algo en vuestras rutinas que hace que se sienta menos apegada a ti.