Hola!
A mí me pasa algo parecido, mi hija claramente se parece más a mi que a su padre de momento, es cierto que conforme van creciendo cambian mucho, aunque en tu caso no creo que si los ojos son oscuros vayan a ponerse verdes o azules de repente, jejeje. El caso es que mi suegra sólo ve el parecido con su padre y yo el optado por pasar del tema, ella es buena y si pensado eso feliz pues ya está aunque todo el mundo diga lo contrario, jajaja. Lo importante es que la adora, la quiere muchísimo y a mi con eso me basta. Intenta no darle tanta importancia, ella sola se dará cuenta conforme vaya pasando el tiempo.

Si te sirve de consuelo, cada cosa que hace mi hijo o tiene (bebé de 2m) es sacado de su abuela paterna (mi suegra).

Si el niño tiene el pelo rubio, como su abuela, si el niño tiene reflejo del moro… Se asusta como su abuela, si se tira un pedo… Como su abuela, así con todo.

Te juro que es que para ella no tiene ningún rasgo mio, mi propio hijo, que es una calcamonia mia. Yo ya me rio.

La mía no para de decir todo lo que se parece la niña a su hijo desde el momento que nació, cosa que es verdad, no lo niego, pero ya con 4 meses la nena va mostrando parte del carácter, hambre y demás…pues oye, que por lo visto también se parece al tito. A lo que yo un día después de estar una semana escuchando esos comentarios le dije: por lo que veo yo he sido un mero recipiente, no? Se parece solo a su padre o a su tío (que no ha aportado nada). Y ya no volvió a decirme nada.
Creo que es mejor decirle las cosas porque al final estás todo el día molesta con su actitud y no se entera (o no quiere enterarse) de nada.